Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROAPQ12815 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms