Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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SH3BP4Q9P0V3 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SH3BP4Q9P0V3 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SH3BP4Q9P0V3 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SH3BP4Q9P0V3 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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