Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SNAPC1Q16533 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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SNAPC1Q16533 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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