Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TNXAQ16473 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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