Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USF2Q15853 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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