Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ITSN1Q15811 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
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ITSN1Q15811 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ITSN1Q15811 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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