Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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COL9A3Q14050 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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COL9A3Q14050 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL9A3Q14050 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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