Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SPTAN1Q13813 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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