Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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GRIN2AQ12879 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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GRIN2AQ12879 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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GRIN2AQ12879 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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GRIN2AQ12879 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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GRIN2AQ12879 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GRIN2AQ12879 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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