Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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ZBED3Q96IU2 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZBED3Q96IU2 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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