Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KNOP1Q1ED39 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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