| UPP1 | Q16831 | LINC02301-203 | ENST00000555798 | 789 nt | TSL 3 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-85P-201 | ENST00000605989 | 107 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL357078.3-201 | ENST00000607528 | 618 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.15-201 | ENST00000611544 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.16-201 | ENST00000613119 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.12-201 | ENST00000613778 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.20-201 | ENST00000613956 | 192 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.9-201 | ENST00000615427 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.11-201 | ENST00000616345 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.2-201 | ENST00000616535 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.3-201 | ENST00000617785 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.19-201 | ENST00000618602 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU2-1-201 | ENST00000618664 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.6-201 | ENST00000619225 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.5-201 | ENST00000619465 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | U2.10-201 | ENST00000620268 | 191 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AK9-203 | ENST00000368948 | 2478 nt | TSL 5 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | LIFR-201 | ENST00000263409 | 10089 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RGPD1-204 | ENST00000559485 | 5247 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | HAS2-201 | ENST00000303924 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | CUL3-203 | ENST00000409096 | 2701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD73A-201 | ENST00000386062 | 65 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | BCL2L11-207 | ENST00000405953 | 425 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC079150.1-201 | ENST00000413043 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | MAMDC2-AS1-203 | ENST00000420573 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | OSTCP8-201 | ENST00000445117 | 448 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP001324.2-201 | ENST00000461163 | 319 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC090096.1-201 | ENST00000489168 | 390 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1069P-201 | ENST00000516612 | 133 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA43.2-201 | ENST00000516652 | 128 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC069113.1-201 | ENST00000517763 | 267 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | BTF3P12-201 | ENST00000519620 | 469 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-323P-201 | ENST00000521915 | 107 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | CYCSP27-201 | ENST00000527643 | 293 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC025423.5-201 | ENST00000550230 | 219 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | UBE2Q2P8-201 | ENST00000560644 | 102 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC131274.4-201 | ENST00000577879 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR5194-201 | ENST00000582634 | 120 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR5692C1-201 | ENST00000585309 | 91 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR51A7-202 | ENST00000641490 | 2186 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | IDE-201 | ENST00000265986 | 5877 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.86-201 | ENST00000363020 | 111 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.157-201 | ENST00000363638 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-748P-201 | ENST00000384648 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1072P-201 | ENST00000384703 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-443P-201 | ENST00000384780 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | EIF4E2P1-201 | ENST00000393781 | 255 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP118-201 | ENST00000410385 | 109 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1148P-201 | ENST00000410992 | 104 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORD56-201 | ENST00000413522 | 71 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL162726.4-201 | ENST00000422010 | 673 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01650-201 | ENST00000438093 | 602 nt | TSL 2 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL359853.2-201 | ENST00000442108 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU7-138P-201 | ENST00000459479 | 64 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | BMPR1B-AS1-201 | ENST00000510795 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA31.18-201 | ENST00000517043 | 134 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR3941-201 | ENST00000582572 | 103 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC060780.3-201 | ENST00000589464 | 80 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL670379.10-201 | ENST00000604330 | 253 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL670379.9-201 | ENST00000605428 | 253 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL137847.3-201 | ENST00000611521 | 109 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC006504.8-201 | ENST00000621046 | 635 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | CYLC1-202 | ENST00000621735 | 379 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RMST_7.1-201 | ENST00000621935 | 268 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC097372.5-201 | ENST00000623665 | 376 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC121333.1-201 | ENST00000567488 | 2709 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | EFCAB3-202 | ENST00000450662 | 1694 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | DEFB125-201 | ENST00000382410 | 587 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | BTLA-202 | ENST00000383680 | 726 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1140P-201 | ENST00000410517 | 106 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RBMX2P4-201 | ENST00000441256 | 376 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02264-201 | ENST00000442020 | 576 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC116666.1-201 | ENST00000453915 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL844175.1-201 | ENST00000455153 | 323 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU7-66P-201 | ENST00000459469 | 62 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007547.1-201 | ENST00000462177 | 490 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC074033.2-201 | ENST00000480669 | 535 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | ODF2L-216 | ENST00000486215 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC079140.5-201 | ENST00000507882 | 310 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | LNX1-AS1-203 | ENST00000511989 | 488 nt | TSL 2 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL117351.2-201 | ENST00000513571 | 157 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA25.11-201 | ENST00000515935 | 105 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU5F-8P-201 | ENST00000515941 | 111 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-358P-201 | ENST00000516564 | 75 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1314P-201 | ENST00000517139 | 104 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR4658-201 | ENST00000584344 | 65 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR5002-201 | ENST00000584713 | 97 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009318.2-201 | ENST00000610917 | 651 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | FAM157A-202 | ENST00000615155 | 405 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL136221.1-201 | ENST00000621449 | 509 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL161782.1-201 | ENST00000622930 | 586 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RBBP8P1-201 | ENST00000449447 | 1844 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF271P-202 | ENST00000465539 | 1970 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-428P-201 | ENST00000362942 | 107 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP393-201 | ENST00000363423 | 117 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |