Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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