Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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