Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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