Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CKAP5Q14008 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CKAP5Q14008 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CKAP5Q14008 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CKAP5Q14008 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CKAP5Q14008 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CKAP5Q14008 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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