Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBFBQ13951 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBFBQ13951 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms