Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GTF2H2Q13888 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms