Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
XRCC4Q13426 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
XRCC4Q13426 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms