Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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