Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CENPEQ02224 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CENPEQ02224 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms