Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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PTPRBP23467 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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