Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms