Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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