Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ALX1Q15699 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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