Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KARSQ15046 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KARSQ15046 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KARSQ15046 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms