Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GPNMBQ14956 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GPNMBQ14956 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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