Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
TUBB3Q13509 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TUBB3Q13509 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TUBB3Q13509 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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TUBB3Q13509 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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TUBB3Q13509 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TUBB3Q13509 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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