Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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