Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms