Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRMP28827 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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