Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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