Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms