Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNAPC1Q16533 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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