Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKN1Q16512 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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