Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK4Q16099 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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