Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEC23AQ15436 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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