Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDE7AQ13946 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDE7AQ13946 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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