Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms