Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SREBF2Q12772 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SREBF2Q12772 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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