Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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HOXD10P28358 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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