Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRCP08575 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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