Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PLD3Q8IV08 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms