Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SHHQ15465 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SHHQ15465 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SHHQ15465 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SHHQ15465 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SHHQ15465 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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SHHQ15465 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SHHQ15465 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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