Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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