Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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