| RUNX3 | Q13761 | RNU2-3P-201 | ENST00000410144 | 191 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-25P-201 | ENST00000411041 | 191 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP33-201 | ENST00000414485 | 327 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P9-201 | ENST00000429856 | 646 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02532-205 | ENST00000430094 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121601.2-201 | ENST00000438019 | 707 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P23-201 | ENST00000440153 | 476 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008154.1-201 | ENST00000453087 | 327 nt | TSL 3 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1183P-201 | ENST00000517054 | 60 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC007336.1-201 | ENST00000576365 | 3828 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092807.2-201 | ENST00000609367 | 243 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf59-209 | ENST00000612977 | 586 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161629.2-201 | ENST00000615347 | 275 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIKESHI-208 | ENST00000618164 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP3A43-217 | ENST00000631161 | 328 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.14-201 | ENST00000638599 | 341 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026241.1-201 | ENST00000517873 | 2142 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRA1P-202 | ENST00000510134 | 1410 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC110491.1-201 | ENST00000562191 | 2010 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | QSER1-204 | ENST00000527788 | 5052 nt | TSL 2 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AKAP9-203 | ENST00000359028 | 12247 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB107A-201 | ENST00000335021 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZBTB8OSP1-201 | ENST00000342688 | 498 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB107B-201 | ENST00000355602 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.86-201 | ENST00000363020 | 111 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP393-201 | ENST00000363423 | 117 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-51P-201 | ENST00000365345 | 176 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | S100A12-201 | ENST00000368737 | 518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BTLA-202 | ENST00000383680 | 726 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MT-TL1-201 | ENST00000386347 | 75 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003170.3-201 | ENST00000399123 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF7P8-201 | ENST00000402994 | 292 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003092.1-201 | ENST00000415536 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355314.2-201 | ENST00000427182 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUMO1P4-201 | ENST00000429430 | 302 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LANCL1-AS1-203 | ENST00000433296 | 864 nt | TSL 2 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERLEC1P1-201 | ENST00000433806 | 578 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098831.1-201 | ENST00000440661 | 216 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRPS1P1-201 | ENST00000445305 | 876 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013727.2-201 | ENST00000447761 | 545 nt | TSL 4 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFB1P2-201 | ENST00000449477 | 176 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL583843.1-201 | ENST00000456070 | 346 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092798.1-201 | ENST00000458542 | 409 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117503.1-201 | ENST00000472241 | 394 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083904.1-201 | ENST00000487828 | 231 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC106892.1-201 | ENST00000491608 | 406 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018710.1-201 | ENST00000506509 | 158 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC145146.2-202 | ENST00000508118 | 326 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC092747.1-202 | ENST00000540595 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR11H5P-201 | ENST00000554039 | 926 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5194-201 | ENST00000582634 | 120 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000787.2-201 | ENST00000604432 | 568 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021646.1-201 | ENST00000605469 | 484 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNQ1OT1_3.1-201 | ENST00000616504 | 116 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HOTTIP_4.1-201 | ENST00000618195 | 165 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136221.1-201 | ENST00000621449 | 509 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100810.6-201 | ENST00000638068 | 285 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF519P1-201 | ENST00000449011 | 1626 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CATSPERB-201 | ENST00000256343 | 3623 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EYS-211 | ENST00000503581 | 10589 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR412-201 | ENST00000362142 | 91 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.88-201 | ENST00000363029 | 99 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD14B-201 | ENST00000364533 | 90 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-393P-201 | ENST00000384475 | 107 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1179P-201 | ENST00000384667 | 107 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP219-201 | ENST00000390940 | 113 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-482P-201 | ENST00000391068 | 107 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-876P-201 | ENST00000391295 | 104 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.623-201 | ENST00000411128 | 95 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353621.1-201 | ENST00000418219 | 243 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CALM1P1-201 | ENST00000442082 | 433 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL078601.1-201 | ENST00000444542 | 271 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01162-201 | ENST00000447262 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01774-201 | ENST00000453569 | 595 nt | TSL 2 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1208P-201 | ENST00000459588 | 107 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP42-201 | ENST00000471152 | 471 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRDX4P1-201 | ENST00000507189 | 574 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC116337.1-201 | ENST00000509680 | 687 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074344.1-201 | ENST00000512823 | 224 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104136.1-201 | ENST00000512969 | 394 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022634.1-201 | ENST00000520765 | 532 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC106038.1-203 | ENST00000522132 | 362 nt | TSL 2 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF235103.2-201 | ENST00000525753 | 346 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001783.1-202 | ENST00000534620 | 408 nt | TSL 2 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRC37A5P-203 | ENST00000580181 | 585 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011477.3-201 | ENST00000585571 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |