Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HTR4Q13639 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HTR4Q13639 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms