Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRAF1Q13077 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms