Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TTPAP49638 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TTPAP49638 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TTPAP49638 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TTPAP49638 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TTPAP49638 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TTPAP49638 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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TTPAP49638 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TTPAP49638 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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