Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD10P28358 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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